邪正的盛衰变化，对于疾病的发生、发展及其变化和转归，都有重要的影响。疾病的发生与发展是正气与邪气斗争的过程。正气充沛，则人体有抗病能力，疾病就会减少或不发生；若正气不足，疾病就会发生和发展。因此，治疗的关键就是要改变正邪双方力量的对比，扶助正气，祛除邪气，使疾病向痊愈的方向转化。
扶正：就是使用扶正的药物或其它方法，以增加体质，提高抗病能力，以达到战胜疾病、恢复健康的目的。适用于正气虚为主的疾病，临床上根据不同的病情，有益气、养血、滋阴、壮阳等不同的方法。
祛邪：就是祛除体内的邪气，达到邪去正复的目的。适用于邪气为主的疾病，临床上根据不同的病情，有发表、攻下、清解、消导等不同方法。
临床运用扶正祛邪这一原则，要认真细致地观察邪正消长的盛衰情况，根据正邪双方在疾病过程中所处的不同地位，分清主次、先后、灵活地运用。总之，要以“扶正不留邪，祛邪不伤正”为原则。